劳务派遣员工不配合用人单位工作，用人单位不能直接辞退，但可依法将其退回劳务派遣单位，由劳务派遣单位根据情况处理。以下从不同角度详细分析：
一、法律关系与退回依据
三方主体关系：
- 派遣单位（用人单位）：与劳动者签订劳动合同，承担雇主责任。
- 用工单位（实际工作单位）：接受派遣员工提供劳务，无直接劳动关系，但有权对派遣员工的工作表现进行管理和评价。
- 劳动者：与派遣单位存在劳动合同关系，被派至用工单位工作。
退回的法定情形：
- 根据《劳动合同法》第六十五条，被派遣劳动者有严重违反用人单位规章制度、不能胜任工作等情形的，用工单位可以将劳动者退回劳务派遣单位。不配合工作若构成严重违反规章制度或不能胜任工作，则属于合法退回情形。
二、退回与辞退的流程
用工单位退回：
- 用工单位应收集劳动者不配合工作的证据，如书面警告、工作记录、同事证言等。
- 用工单位需提前将退回意向通知劳务派遣单位，并说明退回事由及相关证据。
劳务派遣单位处理：
- 劳务派遣单位应依据法律和派遣协议，与被退回员工进行沟通，说明退回原因、依据及相关权益。
- 若劳动者存在过错，劳务派遣单位可依法解除劳动合同，并支付相应的经济补偿（按每满一年支付一个月工资的标准计算）。
- 若劳动者无过错，劳务派遣单位应考虑是否为其安排其他工作，或协商解除劳动合同并支付经济补偿。
三、劳动者的权益保障
经济补偿：
- 若劳务派遣单位依法解除劳动合同，应支付经济补偿。经济补偿标准按劳动者在本单位工作年限计算，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资。
违法解除的救济：
- 若劳务派遣单位或用工单位无故辞退劳动者，劳动者可要求继续履行合同或主张赔偿金（经济补偿标准的两倍）。
其他权益：
- 劳动者有权要求劳务派遣单位办理工作交接、结算工资、出具离职证明等手续。
- 劳动者还有权要求转移社保关系，并享受未休年假的工资报酬等权益。
四、实务建议
保留证据：
- 用工单位应妥善保存劳动者不配合工作的证据，以备在退回或劳动争议中使用。
依法操作：
- 用工单位和劳务派遣单位应严格遵循法律规定，确保退回和辞退流程的合法性。
及时沟通：
- 在退回或辞退过程中，用工单位和劳务派遣单位应与劳动者保持及时沟通，解释相关政策和权益，避免引发不必要的劳动纠纷。
示例：假设某劳务派遣员工在用工单位工作期间，多次拒绝执行合理的工作任务，且经多次警告仍不改正。用工单位可收集相关证据（如书面警告、工作记录等），并提前通知劳务派遣单位将其退回。劳务派遣单位在收到退回通知后，应与劳动者进行沟通，说明退回原因和依据。若劳动者存在过错，劳务派遣单位可依法解除劳动合同，并支付相应的经济补偿。
如有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。