面对老板不承认你在公司上班且没有直接证据的情况，你仍然可以通过积极收集间接证据并采取法律措施来维护自己的权益。以下是从不同角度为你提供的分析和建议：
一、收集间接证据
工作记录：
- 打卡记录：如果你有打卡上班的习惯，可以尝试从公司系统或打卡机中获取打卡记录，这能证明你某段时间内在公司。
- 工作邮件：查看你的工作邮箱，保存与工作相关的邮件往来，特别是那些涉及工作任务分配、工作进度汇报的邮件。
- 工作群消息：如果你加入了公司的工作群，可以保存群内的聊天记录，特别是那些能证明你参与工作讨论或接受工作任务的记录。
同事证言：
- 寻找了解你工作情况的同事，请他们出具书面证言或作为证人出庭作证。同事的证言可以证明你与公司存在劳动关系以及你的工作情况。
与老板的协商录音：
- 在与老板协商时，可以巧妙地诱导其谈及你在公司上班的事实，并偷偷录音。但需注意，录音需合法取得，不得侵犯他人隐私或违反法律规定。
二、采取法律措施
向劳动监察部门投诉：
- 你可以携带能证明你身份和工作情况的初步材料（如工作证、同事证言等）向当地劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权对用人单位进行调查检查，并责令其支付工资或确认劳动关系。
申请劳动仲裁：
- 如果投诉无果，你可以向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁。在申请仲裁时，你需要提交仲裁申请书，说明仲裁请求及事实理由。仲裁委受理后会进行审理，如果你能提供初步证据证明存在劳动关系，举证责任可能会转移给用人单位，要求其提供工资支付记录等证据。
提起诉讼：
- 如果对仲裁结果不服，你还可以在规定时间内向法院提起诉讼。在诉讼过程中，你需要继续提供证据支持你的主张。虽然在没有直接证据的情况下诉讼风险较大，但如果你能提供充分的间接证据，仍然有可能赢得诉讼。
三、注意事项
- 保留证据：在日常工作中，要注意保留各类与工作和劳动关系相关的证据，以备不时之需。
- 及时维权：一旦发现老板不承认你在公司上班或拖欠工资等情况，要及时采取措施维权，避免超过诉讼时效。
- 咨询专业律师：虽然我作为李玉松律师已经为你提供了详细的建议，但在实际操作过程中，如果你遇到任何疑问或困难，都可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供更专业的法律帮助。
最后，我想强调的是，面对老板不承认你在公司上班且没有直接证据的情况，不要慌张也不要放弃。通过积极收集间接证据并采取法律措施，你仍然有可能维护自己的权益。如果你有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。