针对您提出的“职工因自己原因不能上班，与单位签订停薪留职社保全部由职工承担的合法性”问题，以下是我的详细解答：

1. 关于停薪留职协议的合法性：

   • 停薪留职协议本身在法律上并不被禁止，只要双方自愿、平等、协商一致，并且不违反法律法规的强制性规定，该协议就是有效的。然而，关键在于协议的具体内容是否合法合规。

2. 关于社保全部由职工承担的合法性：

   • 根据《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，用人单位和职工应当共同缴纳社会保险费。这意味着，社保费用原则上应由用人单位和职工按比例分担，而不是全部由职工承担。
   • 如果停薪留职协议中约定社保全部由职工承担，这可能违反了法律法规的强制性规定，因为该约定改变了社保费用的法定分担方式。因此，从法律角度来看，这样的约定可能是不合法的。

3. 实际操作中的建议：

   • 对于职工而言，如果因个人原因需要停薪留职，应与单位充分协商，明确停薪留职期间的权利义务，包括社保费用的分担方式。如果单位要求职工承担全部社保费用，职工应谨慎考虑，并可以咨询专业律师以了解自己的合法权益。
   • 对于单位而言，应遵守法律法规的规定，合理分担社保费用，避免因违法约定而引发法律纠纷。

综上所述，停薪留职协议本身在法律上并不被禁止，但协议中关于社保全部由职工承担的约定可能违反了法律法规的强制性规定，因此是不合法的。如果您在停薪留职或社保费用分担方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。