针对您提出的“老板有两个厂，劳动仲裁另一个厂可以执行吗”这一问题，我们需要从多个角度进行分析，以确保您能全面理解并正确处理此类劳动争议。

1. 明确劳动关系主体：

   • 首先，您需要确定自己与哪个厂建立了劳动关系。这通常通过劳动合同、工资发放记录、工作安排等证据来确认。如果仅与其中一个厂建立了劳动关系，那么劳动仲裁应针对该厂进行。
   • 如果两个厂在业务范围、人员管理、财务等方面高度混同，导致您难以区分实际用人单位，那么您可以将两个厂列为共同被申请人，要求它们共同承担法律责任。

2. 责任承担分析：

   • 若经仲裁认定，您仅与其中一个厂存在劳动关系，那么该厂将独立承担劳动法律责任，如支付拖欠工资、经济补偿等。
   • 若两个厂被认定为混同用工，那么它们可能需对您的各项诉求承担连带责任。这意味着您有权要求其中任何一个或两个厂共同履行支付义务。

3. 劳动仲裁的申请流程：

   • 准备仲裁资料：包括劳动仲裁申请书、劳动关系证明材料（如劳动合同、工作证、考勤记录、工资发放记录等）、证据材料（与仲裁请求相关的证据，如加班证据、未足额支付工资的证据等）以及被申请人的工商登记信息等。
   • 提交仲裁申请：向有管辖权的劳动仲裁委员会提交仲裁申请书及相关证据材料。一般来说，劳动仲裁委员会是劳动合同履行地或者用人单位所在地的仲裁委。
   • 等待受理通知：劳动仲裁委员会在收到申请书之日起五日内会作出是否受理的决定，并通知申请人。
   • 参加庭审：如果仲裁委同意受理，会安排开庭审理。您需要按时参加庭审，明确仲裁请求，进行陈述和质证。
   • 接受仲裁裁决：劳动仲裁委员会会根据双方提供的证据和法律规定，作出具有法律效力的仲裁裁决。

4. 注意事项：

   • 仲裁时效：您需注意仲裁时效，一般为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。超过时效可能会影响仲裁请求的受理。
   • 证据收集：在申请劳动仲裁前，您应尽可能全面、客观地收集与劳动争议相关的证据，以支持自己的仲裁请求。证据应真实、合法、有效，且能够形成完整的证据链。
   • 法律程序：在申请劳动仲裁时，您应遵循法律程序，如实陈述事实，提供证据，并按时参加庭审等。不遵守法律程序可能会影响仲裁结果的公正性和有效性。

综上所述，当老板拥有两个厂且发生劳动争议时，您应首先明确自己的劳动关系主体，然后根据实际情况选择合适的仲裁策略。在申请劳动仲裁时，务必遵循法律程序，全面收集证据，以确保自己的合法权益得到有效维护。如果您在处理此类问题时遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我将为您提供专业的法律建议和帮助。