针对您提出的问题“本人申请调入分公司，总公司按离职处理，违法吗”，以下是我的详细解答：

1. 从法律主体角度分析：

   • 总公司和分公司在法律上通常是两个独立的主体。当您申请从总公司调入分公司时，如果涉及劳动合同主体的变更（即从与总公司签订的劳动合同变更为与分公司签订），那么理论上确实需要先解除与总公司的劳动合同，再与分公司重新签订劳动合同。但这一过程并不等同于“被离职”，而是劳动合同主体的变更。
   • 如果总公司未经您同意，单方面将您的劳动关系解除，并视为离职处理，而您实际上并未同意解除与总公司的劳动关系，也未与分公司签订新的劳动合同，那么总公司的这种做法可能构成违法解除劳动合同。

2. 从劳动合同变更角度分析：

   • 劳动合同的变更（包括工作地点的变更）通常需要双方协商一致，并签订书面的变更协议。如果总公司未经您同意，擅自将您的劳动关系转移至分公司，并视为离职处理，这违反了劳动合同变更的协商一致原则。
   • 在这种情况下，您有权要求总公司继续履行原劳动合同，或者要求总公司支付违法解除劳动合同的赔偿金。

3. 从实际操作角度分析：

   • 在实际操作中，许多公司为了简化流程或出于其他考虑，可能会要求员工先办理离职手续，再与分公司重新签订劳动合同。但这种做法必须建立在员工同意的基础上，并且应当明确告知员工相关后果和权益。
   • 如果您对总公司的这种做法有异议，建议您先与总公司的人力资源部门进行沟通，了解具体原因和解决方案。如果沟通无果，您可以考虑向当地的劳动监察大队进行投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

法律建议：

• 在面对此类情况时，建议您首先保留好与总公司沟通的相关证据（如邮件、聊天记录等），以便在后续维权过程中使用。
• 如果您认为总公司的做法违法，且沟通无果，建议您及时申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在申请劳动仲裁前，您可以咨询专业律师（如我）以获取更具体的法律建议和帮助。

总之，总公司未经您同意将您的劳动关系视为离职处理并转移至分公司的做法可能构成违法解除劳动合同。您有权要求总公司继续履行原劳动合同或支付赔偿金。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。