经营超过保质期的食品，确实可能同时违反《食品安全法》第五十四条的规定，但具体是否构成违法以及如何定性，需要结合实际情况和相关法律法规进行综合判断。以下是我对此问题的详细分析：

1. 经营超过保质期食品的违法性：

   • 根据《食品安全法》第三十四条第（十）项的规定，禁止经营超过保质期的食品。因此，如果食品经营者确实销售了超过保质期的食品，那么这一行为显然是违法的。

2. 第五十四条规定的适用性：

   • 《食品安全法》第五十四条第一款规定，食品生产经营者应及时清理过期食品。这一规定强调了食品生产经营者对过期食品的管理责任，要求他们定期检查并清理库存中的过期食品，以防止过期食品流入市场。
   • 如果食品经营者未按照这一规定及时清理过期食品，即使这些食品尚未被销售，也可能构成违法行为，因为这违反了食品生产经营者对过期食品的管理义务。

3. 经营过期食品与未及时清理过期食品的区别：

   • 在实践中，对于在食品经营场所发现过期食品的情况，是认定为经营过期食品还是认定为未及时清理过期食品，可能存在争议。这主要取决于过期食品被发现时的具体状态、位置以及是否有证据证明其已被销售或用于加工。
   • 如果过期食品被发现时已处于待售状态，或者有证据证明其已被销售或用于加工，那么更可能被认定为经营过期食品。
   • 如果过期食品被发现时仅处于库存中，且无证据证明其已被销售或用于加工，那么可能更倾向于被认定为未及时清理过期食品。

4. 法律后果与处罚：

   • 对于经营过期食品的行为，根据《食品安全法》第一百二十四条第一款的规定，罚款最少是5万元。
   • 对于未及时清理过期食品的行为，根据《食品安全法》第一百三十二条的规定，最轻是责令改正，给予警告。如果情节严重，也可能面临罚款等处罚。

5. 建议与注意事项：

   • 食品经营者应严格遵守《食品安全法》的相关规定，定期检查并清理库存中的过期食品，以防止过期食品流入市场。
   • 如果在经营过程中发现过期食品，应立即采取措施进行下架、标识或销毁等处理，并保留相关证据以备查验。
   • 对于消费者而言，在购买食品时应仔细查看食品的生产日期和保质期等信息，避免购买到过期食品。

综上所述，经营超过保质期的食品确实可能同时违反《食品安全法》第五十四条的规定。但具体是否构成违法以及如何定性，需要结合实际情况和相关法律法规进行综合判断。如果您在经营过程中遇到此类问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。