针对您提出的“个体户三年前的雇员怎么处理”这一问题，这确实是一个涉及劳动法律关系和个体工商户责任承担的重要议题。下面，我将从几个方面为您详细解答：

一、劳动关系确认

首先，要确认的是个体户与雇员之间是否存在劳动关系。根据《劳动和社会保障部关于确立劳动关系有关事项的通知》（劳社部发[2005]12号）第一条，如果用人单位和劳动者符合法律、法规规定的主体资格，劳动者接受用人单位的管理，从事用人单位安排的有报酬的劳动，且劳动者提供的劳动是用人单位业务的组成部分，那么劳动关系即成立。

对于三年前的雇员，如果当时存在上述劳动关系，那么这种关系在法律上是受到保护的。

二、个体户注销后的责任承担

如果个体户已经注销，但其注销前与雇员存在劳动关系，那么根据《中华人民共和国民法典》第五十六条第一款，个体工商户的债务，个人经营的，以个人财产承担。这意味着，如果个体户是个人经营，那么其经营者应当对雇员的工资、未签订书面劳动合同的二倍工资差额、经济补偿金等债务承担责任。

三、具体处理措施

1. 确认劳动关系：

   • 如果雇员与个体户之间存在劳动关系，且个体户已经注销，雇员可以首先尝试与个体户的经营者协商解决。
   • 如果协商无果，雇员可以向劳动人事争议仲裁委员会申请仲裁，要求确认劳动关系并支付相关费用。

2. 法律途径：

   • 如果仲裁委员会作出不利于雇员的裁决，雇员可以向法院提起诉讼，要求确认劳动关系并判令经营者支付所欠工资、未签订书面劳动合同的二倍工资差额以及赔偿金等。

3. 证据收集：

   • 在处理此类问题时，雇员应当收集并保留与个体户存在劳动关系的证据，如工作证、工资条、考勤记录、与经营者的沟通记录等。

四、注意事项

1. 时效性：

   • 需要注意的是，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，雇员在发现权利被侵害后，应当及时采取行动。

2. 法律咨询：

   • 在处理此类复杂问题时，建议雇员咨询专业律师或法律机构，以获取更具体、更专业的法律建议。

综上所述，对于三年前的个体户雇员，如果当时存在劳动关系且个体户已经注销，雇员可以通过法律途径要求经营者承担责任。在处理此类问题时，雇员应当收集并保留相关证据，并咨询专业律师或法律机构以获取更具体的法律建议。