当交通事故中对方全责，但对方保险公司的理赔金额不足以弥补您的损失时，您完全有权选择起诉对方（即肇事方）来维护自身的合法权益。以下是对这一问题的详细解答：
一、理赔不足时的处理方式
协商先行：
- 在考虑法律手段之前，建议您首先与事故责任方及保险公司进行协商，尝试达成一个合理的赔偿协议。这不仅可以节省时间和成本，还有助于双方关系的和谐。
法律手段：
- 如果协商无果，或者对方拒绝承担应有的赔偿责任，您可以采取法律手段来保护自己的权益。具体来说，您可以将责任方（肇事方）及其保险公司列为共同被告，向人民法院提起诉讼。
二、起诉的法律依据和准备
法律依据：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十四条，对交通事故损害赔偿的争议，当事人可以请求公安机关交通管理部门调解，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。如果调解不成或者调解书生效后不履行，当事人可以向人民法院提起民事诉讼。
起诉准备：
- 在起诉前，您需要准备一系列证据来支持您的主张，包括但不限于交通事故认定书、医疗费用清单、车辆损失评估报告、收入损失证明等。这些证据将用于证明您的损失数额以及对方应承担的赔偿责任。
诉讼时效：
- 请注意，提起民事诉讼有时效限制，一般为三年。从您知道或者应当知道权利被侵害之日起计算，如果超过了这一时效期限，您的起诉可能会被视为无效。
三、诉讼过程中的注意事项
赔偿标准的确定：
- 在诉讼过程中，请务必重视赔偿标准的确定。这包括但不限于医疗费用、误工费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费、营养费、残疾赔偿金、死亡赔偿金等。确保您的权益得到充分保障。
法院调解：
- 在诉讼过程中，法院可能会尝试进行调解，以寻求双方都能接受的解决方案。这是一种高效且成本较低的解决方式，值得您考虑。
综上所述，当对方保险公司的理赔金额不足以弥补您的损失时，您完全有权选择起诉对方来维护自己的合法权益。在起诉前，请务必做好充分的准备，并咨询专业的法律人士以获取更详细的法律建议和指导。