当交通事故对方全责时，公司应当主动帮员工申请工伤。以下是详细分析：

1. 工伤认定条件：

   • 根据相关规定，职工在上下班途中，如果遭遇了非本人主要责任的交通事故，应当被认定为工伤。这意味着，即使交通事故中对方全责，员工也有权申请工伤认定。

2. 公司的责任：

   • 公司在员工发生工伤事故后，有责任按照规定时间向统筹地区的社会保险行政部门提出工伤认定申请。这是公司的法定义务，无论事故责任方是谁。
   • 公司需要准备相关材料，如事故责任认定书、医疗诊断证明等，以支持工伤认定申请。

3. 员工的权益：

   • 一旦工伤认定成功，员工将享受一系列工伤待遇，包括工伤医疗费用的报销、停工留薪期工资、伤残津贴等。
   • 工伤认定并不影响员工向肇事方主张民事赔偿的权利。员工可以同时获得工伤赔偿和民事赔偿，但部分赔偿项目可能会存在竞合，具体根据当地规定执行。

4. 实际操作建议：

   • 员工在发生交通事故后，应及时向公司报告，并保留好相关证据材料。
   • 公司应积极配合员工申请工伤认定，确保员工的合法权益得到保障。
   • 如果公司未按规定时间提出工伤认定申请，员工或其近亲属、工会组织可以在规定时间内直接向社会保险行政部门提出申请。

综上所述，当交通事故对方全责时，公司应当主动帮员工申请工伤，以确保员工的合法权益得到及时有效的保障。如果公司在此过程中有任何不配合或疏忽行为，员工可以及时向我咨询，我将为你提供专业的法律支持和建议。