公司确实有义务在特定时间内帮员工申请工伤认定，这是基于法律法规的明确规定。以下是对这一问题的详细解答：
一、公司的法定义务
提出工伤认定申请：
- 根据《工伤保险条例》第十七条的规定，职工发生事故伤害或者被诊断、鉴定为职业病后，公司应在30日内向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。这是公司的法定义务，旨在保障工伤职工的合法权益，确保他们能够及时获得工伤保险待遇。
缴纳工伤保险费：
- 公司应依法为职工缴纳工伤保险费，这也是公司的法定义务。如果公司未依法缴纳工伤保险费，发生工伤事故的，由公司支付工伤保险待遇。这意味着，即使公司未按时提出工伤认定申请，但如果已经为职工缴纳了工伤保险费，工伤保险基金仍可能承担部分或全部工伤保险待遇。然而，如果公司既未提出申请又未缴纳保险费，则将面临承担全部工伤保险待遇的风险。
二、未履行义务的法律后果
承担工伤待遇费用：
- 如果公司未在规定时限内提出工伤认定申请，期间发生的工伤待遇等有关费用将由公司负担。这包括医疗费、伙食补助费、生活护理费、工伤期间的工资、交通食宿费、辅助器具费等。如果造成伤残或死亡，还有一次性伤残补助金、伤残津贴、一次性工伤医疗补助金、一次性伤残就业补助金、丧葬补助金、一次性伤亡补助金以及供养亲属抚恤金等。
可能的行政处罚：
- 除了承担工伤待遇费用外，公司还可能面临社会保险行政部门的行政处罚。虽然具体的处罚措施可能因地区而异，但通常包括罚款、警告等。这些处罚旨在督促公司履行其法定义务，保障工伤职工的合法权益。
三、特殊情况下的处理
- 如果工伤是由第三人的原因造成的，且第三人不支付工伤医疗费用或者无法确定第三人的，由工伤保险基金先行支付。工伤保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。在这种情况下，公司仍需配合相关部门进行工伤认定和赔偿工作，但可能不需要直接承担工伤待遇费用。
四、建议与注意事项
及时提出申请：
- 公司应在职工发生工伤后尽快提出工伤认定申请，以避免承担不必要的费用和风险。同时，公司也应积极配合相关部门进行工伤认定和劳动能力鉴定工作。
完善内部管理：
- 公司应建立健全的工伤保险管理制度，确保为职工按时缴纳工伤保险费，并在发生工伤事故时及时提出申请。这有助于降低公司的法律风险，并保障工伤职工的合法权益。
咨询专业律师：
- 如果公司在处理工伤事故时遇到法律问题或困惑，可以咨询专业律师以获取准确的法律意见和指导。作为专业律师，我可以为公司提供全面的法律咨询和解决方案。
总结来看，公司有义务在特定时间内帮员工申请工伤认定，并依法为职工缴纳工伤保险费。如果公司未履行这些义务，将可能承担工伤待遇费用和行政处罚等法律后果。因此，公司应高度重视工伤保险管理工作，确保为职工提供充分的保障。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。