结论是：在工伤认定中，员工自身是否承担主要责任，通常不影响工伤的认定和公司应承担的赔偿责任。 以下是详细分析：
一、工伤认定的基本原则
根据《工伤保险条例》的相关规定，工伤认定主要遵循“无过错责任原则”。这意味着，只要员工是在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害，或者符合其他工伤认定的情形（如上下班途中受到非本人主要责任的交通事故伤害等），就应当被认定为工伤，而不论员工自身是否存在过错或是否承担主要责任。
二、员工主要责任与工伤认定的关系
一般情况：在大多数工伤事故中，员工即使承担一定的责任（包括主要责任），也不影响工伤的认定。因为工伤认定的核心在于事故是否与工作相关，而非员工是否承担责任。
例外情况：虽然员工主要责任通常不影响工伤认定，但也有一些特殊情况需要注意。例如，如果员工故意犯罪、醉酒或者吸毒导致事故发生，那么根据《工伤保险条例》的规定，这些情形将不被认定为工伤。然而，这些例外情况与员工是否承担主要责任无直接关联，而是基于员工的故意行为或违法状态。
三、公司的赔偿责任
一旦员工被认定为工伤，公司就有义务按照《工伤保险条例》的规定，为员工提供相应的工伤保险待遇。这包括但不限于医疗费用、康复费用、停工留薪期间的工资福利、伤残津贴等。公司的赔偿责任并不因员工在事故中承担主要责任而减轻或免除。
四、实际操作中的注意事项
及时申请工伤认定：员工在发生工伤事故后，应及时向公司报告，并由公司或员工本人（或其近亲属）在规定时间内向社会保险行政部门提出工伤认定申请。
保留相关证据：员工应尽可能保留与工伤事故相关的证据，如医疗记录、事故现场照片、证人证言等，以便在工伤认定和后续赔偿过程中提供有力支持。
了解赔偿流程：员工应了解工伤保险待遇的赔偿流程和相关规定，确保自己的合法权益得到充分保障。
建议：如果你或你身边的人遇到了工伤事故，并且对工伤认定和赔偿流程有疑问，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供详细的法律解答和专业的法律建议。