工伤不认定后，不会倒扣工资。下面我详细解释一下这个问题：

在工伤鉴定结果未出时，或者工伤未被认定的情况下，职工的薪酬发放有特定的规定。根据相关规定，如果职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗，那么在“停工留薪期”内，职工的原工资及福利待遇是不变的，由用人单位按月支付。这个停工留薪期一般不超过12个月，如果伤情严重或者情况特殊，经过市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长时间也不得超过12个月。

也就是说，即使工伤最终没有被认定，但在停工留薪期内，用人单位仍然需要按照职工的原工资及福利待遇进行支付，而不能倒扣工资。

当然，如果工伤职工在停工留薪期满后仍需治疗，或者经过治疗后不能恢复工作，那么就需要按照相关的劳动法规进行进一步的处理，比如享受病假待遇、解除劳动关系并支付经济补偿等。但这些情况都与“工伤不认定后倒扣工资”这个问题无关。

总之，工伤不认定后，用人单位不会倒扣工资，而是需要按照相关规定支付停工留薪期内的工资及福利待遇。如果用人单位违反了这个规定，职工可以向劳动监察部门投诉或者提起劳动仲裁来维护自己的合法权益。