企业合理设置员工工资结构并规避后期劳动争议赔偿风险，特别是工伤赔偿风险，是一个系统性且细致的工作。以下是一些建议，帮助企业实现这一目标：

一、合理设置员工工资结构

1. 明确工资构成：

   • 工资应由基本工资、绩效奖金、津贴补贴、加班工资等明确部分构成。
   • 基本工资应作为工资的主要部分，确保员工的稳定收入。
   • 绩效奖金和津贴补贴可根据企业实际情况和员工的工作表现进行灵活调整。

2. 遵守法律法规：

   • 确保工资水平不低于当地最低工资标准。
   • 按时足额支付工资，避免拖欠或克扣。

3. 透明化管理：

   • 工资结构应公开透明，让员工清楚了解自己的收入构成。
   • 定期与员工沟通工资调整情况，增强员工的信任感。

4. 激励与约束并重：

   • 通过设置合理的绩效奖金和晋升机会，激励员工积极工作。
   • 同时，对违反公司规定或工作表现不佳的员工，可依法依规进行处罚或降薪。

二、规避劳动争议赔偿风险

1. 完善劳动合同：

   • 与员工签订书面劳动合同，明确双方的权利和义务。
   • 在劳动合同中详细约定工资结构、支付时间、支付方式等关键条款。

2. 建立健全规章制度：

   • 制定完善的员工手册和规章制度，明确员工的行为规范和考核标准。
   • 确保规章制度的制定程序合法，内容不违反法律法规。

3. 加强培训与教育：

   • 定期对员工进行法律法规和公司规章制度的培训，提高员工的法律意识和遵守制度的自觉性。
   • 对新员工进行入职培训，让其了解公司的文化和规章制度。

4. 及时处理劳动争议：

   • 建立劳动争议处理机制，及时发现和解决劳动争议。
   • 对员工的投诉和申诉进行认真调查和处理，避免矛盾激化。

三、特别关注工伤赔偿风险

1. 加强安全生产管理：

   • 建立健全安全生产管理制度，落实安全生产责任。
   • 定期对员工进行安全生产培训，提高员工的安全意识和操作技能。

2. 依法参加工伤保险：

   • 按照法律规定为员工缴纳工伤保险费，确保员工在发生工伤时能够获得及时有效的医疗救治和经济补偿。

3. 完善工伤处理流程：

   • 制定完善的工伤处理流程，明确工伤申报、认定、赔偿等各个环节的责任和时限。
   • 在员工发生工伤时，及时启动工伤处理流程，确保员工的合法权益得到保障。

综上所述，企业合理设置员工工资结构并规避后期劳动争议赔偿风险需要企业在多个方面进行努力。通过明确工资构成、遵守法律法规、透明化管理、激励与约束并重等措施来合理设置工资结构；通过完善劳动合同、建立健全规章制度、加强培训与教育、及时处理劳动争议等措施来规避劳动争议赔偿风险；同时，特别关注工伤赔偿风险，加强安全生产管理、依法参加工伤保险、完善工伤处理流程等。这些措施的实施将有助于企业构建和谐稳定的劳动关系，促进企业的健康发展。