在劳动仲裁申请书中，应当详细列明公司欠付的所有款项，但也要根据具体情况合理组织和表述。以下是对这一问题的详细分析：

1. 列明所有欠款的必要性：

   • 法律依据：根据《劳动争议调解仲裁法》及相关规定，劳动仲裁申请书应当明确仲裁请求和所根据的事实、理由。列明公司欠付的所有款项，是明确仲裁请求的重要组成部分。
   • 全面反映争议：详细列明欠款，有助于仲裁机构全面了解劳动争议的情况，从而作出公正裁决。
   • 避免遗漏：如果在申请书中遗漏了某些欠款，可能会在后续的仲裁程序中造成不必要的麻烦，甚至可能影响裁决结果。

2. 合理组织和表述欠款：

   • 分类列明：可以根据欠款的性质（如工资、加班费、奖金、补偿金等）进行分类，并逐项列明。
   • 具体金额和计算依据：对于每项欠款，应尽可能提供具体的金额和计算依据，如工资条、银行流水、加班记录等。
   • 简明扼要：虽然要详细列明欠款，但也要避免冗长和啰嗦，应简明扼要地表述清楚。

3. 注意事项：

   • 确保真实性：列明的欠款必须是真实存在的，且有相应的证据支持。
   • 避免夸大或虚构：夸大或虚构欠款金额和事实，可能会导致仲裁机构的不信任，甚至可能影响裁决结果。
   • 及时更新：如果在仲裁过程中发现新的欠款或证据，应及时向仲裁机构补充提交。

综上所述，劳动仲裁申请书中应当详细列明公司欠付的所有款项，但也要根据具体情况合理组织和表述。如果你在具体操作中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。