公司规定员工不参加培训扣款100元不一定合法，需根据具体情况分析：

1. 合法情形：

   • 合同约定或制度规定明确：如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了员工有义务参加特定培训，且不参加将扣除相应工资，且这些规定符合法律法规要求，经过了民主程序制定并向员工公示，那么扣款是合法的。例如，某公司规定：“员工必须参加专业技能培训，无正当理由不参加者，扣除当月工资100元。”若该规定合法制定并公示，则扣款合法。
   • 培训具有特殊性和必要性：当培训是为了使员工胜任特定工作任务或满足法律法规、行业标准要求时，员工有义务参加。如拒绝参加，公司可依据合理标准扣除工资。例如，建筑公司组织的安全生产培训，员工无故不参加，公司可按规定扣款。

2. 不合法情形：

   • 无约定或规定擅自扣款：若公司未事先通过劳动合同或规章制度告知员工不参加培训会扣款，就单方面扣款，这是不合法的。例如，公司突然通知培训，未说明不参加的后果，之后却扣款，这种行为缺乏法律依据。
   • 培训不合理或非必要：如果培训内容与公司业务无关，或培训安排在员工休息时间且没有补偿，员工拒绝参加，公司扣款也是不合理的。例如，要求员工参加与业务无关的金融投资培训，并因此扣款，这是不合法的。

员工应对措施：

• 与公司沟通协商：员工应首先与公司沟通，了解扣款原因和依据，表达自己对培训的看法和困难，寻求解决方案。
• 申请劳动仲裁：若沟通无果，员工认为权益受侵害，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，提供相关证据支持自己的主张。

法律依据：

• 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》，用人单位无权直接对员工进行罚款。罚款是行政处罚的一种，仅由行政机关实施。
• 公司应依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者合法权益。罚款行为可能侵犯劳动者权益，与法律法规相违背。

综上所述，公司规定员工不参加培训扣款100元是否合法，需根据具体情况判断。员工在面对此类问题时，应了解自己的权益和公司的规定，采取合适的应对措施。如有疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。