申请工亡赔偿时，不应当扣除申请诉讼确认劳动关系的时间，目前没有明确的法律规定要求扣除这段时间。下面我将从几个方面详细解释这个问题：

1. 法律关系确认的必要性：

   • 在申请工亡赔偿之前，确认劳动关系是必要的一步。因为工亡赔偿是基于劳动关系的存在而提出的，如果劳动关系不明确或存在争议，就需要通过法律途径来确认。
   • 申请诉讼确认劳动关系，是劳动者或用人单位在劳动关系存在争议时，依法维护自身权益的正当行为。

2. 法律未规定扣除时间：

   • 在我国现行的劳动法律法规中，并没有明确规定申请工亡赔偿时需要扣除申请诉讼确认劳动关系的时间。
   • 工亡赔偿的计算通常基于工伤事故的发生时间、劳动者的工资水平、伤残等级或死亡情况等因素，与申请确认劳动关系的时间无直接关联。

3. 实践中的处理：

   • 在实际操作中，申请诉讼确认劳动关系的时间通常不会被扣除在工亡赔偿的计算之外。因为这段时间是劳动者或用人单位为了明确劳动关系而付出的必要努力，不应影响其获得工亡赔偿的权益。
   • 如果因为申请确认劳动关系而导致了工亡赔偿的延迟支付，劳动者可以依法要求用人单位支付相应的迟延履行金或利息。

综上所述，申请工亡赔偿时，不应扣除申请诉讼确认劳动关系的时间。如果你在这方面遇到了问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。