关于脑梗后遗症员工的赔偿问题，这确实是一个涉及多个方面且比较复杂的问题。以下是根据您提供的参考信息，结合实际情况给出的详细解答：

一、可认定为工伤的情况及赔偿

如果员工在工作时间和工作岗位上突发脑梗塞，并且在48小时之内经抢救无效死亡，或者直接死亡，那么这种情况可以被视同工伤。在这种情况下，赔偿内容主要包括：

1. 丧葬补助金：

   • 金额为6个月的统筹地区上年度职工月平均工资。

2. 供养亲属抚恤金：

   • 按照职工本人工资的一定比例发放给由因工死亡职工生前提供主要生活来源且无劳动能力的亲属。
   • 具体标准为：配偶每月40%，其他亲属每人每月30%，孤寡老人或孤儿在上述基础上增加10%。
   • 所有供养亲属的抚恤金之和不得高于因工死亡职工生前的工资。

3. 一次性工亡补助金：

   • 标准为上一年度全国城镇居民人均可支配收入的20倍。

赔偿责任主体方面：

• 如果用人单位已依法缴纳工伤保险，上述费用由工伤保险基金支付。同时，用人单位还需承担停工留薪期内的原工资福利待遇及必要的护理责任。
• 如果用人单位未依法缴纳工伤保险费，则需自行按照工伤保险待遇项目和标准支付全部费用。

二、不能认定为工伤的情况及处理

如果员工突发脑梗塞但未在48小时内死亡，或者发病时不在工作时间或岗位上，那么通常不被视为工伤。在这种情况下：

• 员工可以享受医疗期和病假待遇。
• 医疗期内，用人单位应按照国家规定支付病假工资或疾病救济费，该金额可以低于当地最低工资标准，但不得低于最低工资标准的80%。
• 医疗期满后，若员工无法从事原工作或用人单位另行安排的工作，用人单位可提前30天书面通知或额外支付一个月工资后解除劳动合同，并按员工本单位工作年限每满一年支付一个月工资的经济补偿金。

三、特殊情况的考量

如果员工突发脑梗塞是由第三人的侵权行为导致（如工作场所存在有害因素诱发疾病），那么员工或其近亲属既可以向侵权第三人主张侵权赔偿，也可以视具体情况要求用人单位承担相应责任（如用人单位因过错未提供安全工作环境）。侵权赔偿一般包括医疗费、护理费、误工费、残疾赔偿金（如构成残疾）等。

四、处理建议

1. 及时申请工伤认定：家属或员工应在事故发生后及时向人社部门提交工伤认定申请，并提供相关证明材料。
2. 咨询专业律师：在面对复杂的赔偿问题时，建议咨询专业律师以确保合法权益得到妥善保障。
3. 与用人单位协商：在赔偿事宜上，可以与用人单位进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。

综上所述，脑梗后遗症员工的赔偿问题需要根据具体情况进行细致分析，并依据相关法律法规进行妥善处理。希望以上解答能对您有所帮助。