旷工三天自离后，仍然需要办理离职手续。

从法律角度来看，《中华人民共和国劳动合同法》第五十条规定，用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。即使因旷工被视为自动离职，这一法律规定仍然适用，员工需要完成工作交接等相关手续，以确保用人单位的正常运营秩序不受影响。

对于用人单位而言，要求旷工三天自动离职的员工办理手续，能保证其资产、资料等得到妥善处理和交接，如员工使用的办公设备需归还，工作资料要完整交接给接替人员等。对员工自身来说，办理离职手续也是保障自身权益的必要环节，关系到工资结算、社保减员等事宜。若不办理，可能导致工资结算延迟、社保关系处理不当等问题，进而影响自身利益。

因此，无论从哪个角度来看，旷工三天自动离职后，办理离职手续都是必要的，既是法律要求，也是维护双方权益的重要举措。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。