关于店长以公司名义索取社保费用是否合法，这个问题涉及到店铺的性质、社保缴纳规定以及法律合规性等多个方面。以下是对此问题的详细解答：

首先，我们需要明确店铺的性质。店铺可能是个体工商户，也可能是注册为有限责任公司、股份有限公司等企业形式的公司性质店铺。这两种性质的店铺在社保缴纳上有所不同。

对于个体工商户：

1. 有雇工的个体工商户：根据《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，这类个体工商户需要像企业一样为其雇工缴纳社保，涵盖基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险和生育保险。店长作为雇主或管理者，不能以个人名义直接索取社保费用，而应该按照法定程序为员工缴纳社保。
2. 无雇工的个体工商户：这类个体工商户可以以灵活就业人员身份参加社会保险，一般只能缴纳基本养老保险和基本医疗保险。在这种情况下，店长自己就是参保人，不存在以公司名义索取社保费用的问题。

对于公司性质的店铺：

作为法定的社会保险参保单位，公司必须按照《社会保险法》的规定执行。自成立之日起三十日内，需凭营业执照、登记证书或者单位印章，向当地社会保险经办机构申请办理社会保险登记，并为在职员工依法缴纳社会保险费。店长作为公司的一员或管理者，同样不能以个人名义索取社保费用，而应该按照公司规定和法定程序为员工缴纳社保。

此外，还需要注意以下几点：

1. 地方差异：具体的社保缴纳规定可能因地区而异，建议咨询当地社保局或专业法律人士以获取准确信息。
2. 合规性：确保店铺已合法注册并具备用工资格，是按规定缴纳社保的前提。如果店铺未合法注册或不具备用工资格，那么以公司名义索取社保费用就是不合法的。

综上所述，店长以公司名义索取社保费用是否合法，取决于店铺的性质、社保缴纳规定以及法律合规性等多个因素。在大多数情况下，店长不能以个人名义直接索取社保费用，而应该按照法定程序和公司规定为员工缴纳社保。如果对此有疑问或需要更具体的法律建议，建议咨询当地社保局或专业法律人士。