审计医疗单位发放绩效工资本身并不违法。绩效工资作为员工薪酬的一部分，其发放通常基于员工的工作表现、业绩贡献等因素，并受到单位内部规章制度以及相关法律法规的约束。以下是对这一问题的详细分析：

1. 法律依据：

   • 我国劳动法及劳动合同法等相关法律法规并未明确禁止医疗单位发放绩效工资。相反，这些法律鼓励单位根据员工的工作表现和贡献给予相应的奖励和报酬。
   • 需要注意的是，绩效工资的发放必须遵循公平、公正、合法的原则，不能违反劳动法的相关规定，如最低工资标准、加班工资支付等。

2. 单位内部规章制度：

   • 医疗单位在发放绩效工资时，应制定明确的规章制度，规定绩效工资的发放标准、程序、条件等。
   • 这些规章制度应经过民主程序制定，并向员工公示，确保员工对绩效工资的发放有充分的了解和知情权。

3. 审计的合法性：

   • 审计是对单位财务收支、经济活动等进行监督、评价和鉴证的一种活动。
   • 审计医疗单位发放绩效工资，主要是检查绩效工资的发放是否符合单位内部规章制度、是否遵循相关法律法规等。
   • 如果审计发现绩效工资的发放存在违法违规行为，审计机关将依法进行处理。

综上所述，审计医疗单位发放绩效工资本身并不违法，但前提是绩效工资的发放必须遵循相关法律法规和单位内部规章制度的规定。如果员工对绩效工资的发放有异议或认为存在违法违规行为，可以向单位提出申诉或向相关部门进行举报。同时，我也建议医疗单位在发放绩效工资时，应确保程序的合法性和公正性，避免引发不必要的纠纷。