老板娘账户发放工资，要证明与公司的关系，主要需从转账人与公司的关系、转账目的以及员工确认等几个方面进行证明。具体分析如下：
一. 证明转账人与公司的关系
工商注册信息与公司章程：首先，需要证明从老板娘个人账户转账的人确实是公司的老板娘或与公司有直接关联。这可以通过查阅公司的工商注册信息、公司章程、股东名册等官方文件来确认。这些文件能够明确展示公司的股权结构、管理人员等信息，从而证明转账人与公司的关系。
公司内部文件：如果可能，还可以提供公司内部的相关文件，如授权书或决议，显示该个人账户被用于工资支付的目的。这些文件能够进一步证明老板娘账户发放工资的行为是得到公司授权的，与公司存在直接关联。
二. 证明转账目的
工资单与薪资明细：提供工资单、薪资明细或其他支付凭证，显示转账金额与员工应得的工资数额相匹配。这些文件能够证明转账的目的是为了支付员工的工资，而不是其他性质的款项。
公司内部记录：如果公司有内部的工资支付系统或记录，可以提供相关截图或打印件，证明该笔转账是用于支付工资。这些记录能够展示工资支付的完整流程，包括转账时间、金额、收款人等信息，从而进一步证明转账目的。
三. 员工确认
书面声明或证言：员工可以提供书面声明或证言，确认他们确实收到了来自老板娘个人账户的工资，并且金额正确。这些声明或证言能够直接证明员工已经收到了工资，并且与公司存在劳动关系。
银行对账单或交易记录：如果可能的话，提供员工的银行对账单或交易记录，显示接收到的工资款项。这些记录能够作为客观证据，证明员工已经收到了来自老板娘个人账户的工资款项。
综上所述，通过结合以上几个方面的证据，可以较为全面地证明老板娘账户发放工资与公司之间的关系。我建议在收集证据时，应尽可能全面、详细，以确保证明的有效性和说服力。同时，为了确保合法性和避免潜在风险，企业应尽可能通过正规渠道和对公账户来支付员工工资。如有进一步需要，您可以继续咨询我。