针对员工因自身原因患焦虑症公司怎么处理的问题，以下是一些详细的建议：

首先，公司需要了解并尊重员工的健康状况。焦虑症作为一种心理疾病，同样需要得到关注和治疗。在员工确诊后，公司应与员工进行坦诚的沟通，了解其病情、治疗计划以及可能的工作影响。

在法律层面，根据《劳动合同法》及相关规定，员工因病不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的，在规定的医疗期满后，用人单位可以解除劳动合同。但在此之前，用人单位需要给予员工合理的医疗期，并根据实际情况进行工作调整或提供必要的支持。对于焦虑症患者，由于其病情可能影响到工作效率和表现，公司可以考虑提供更为灵活的工作安排，如调整工作时间、工作内容或提供远程工作等选项。

同时，公司应关注员工的心理健康，可以考虑引入员工援助计划（EAP）或心理健康支持服务，帮助员工应对焦虑和其他心理问题。这不仅有助于员工的康复，还能提高员工的工作满意度和忠诚度。

在员工治疗期间，公司应保持与员工的沟通，定期了解其康复情况，并根据实际情况调整工作安排。如果员工病情严重，无法继续工作，公司可以与其协商解除劳动合同，但应确保遵守相关法律法规，避免违法解除。

此外，公司还可以考虑从预防的角度出发，加强员工的心理健康教育，提高员工对心理健康的认识和重视程度。通过组织心理健康讲座、培训等活动，帮助员工学会应对压力和焦虑的方法，降低心理疾病的发生风险。

综上所述，对于员工因自身原因患焦虑症的情况，公司应给予充分的关注和支持，提供合理的工作安排和必要的心理健康支持服务。同时，公司也应遵守相关法律法规，确保在处理员工问题时合法合规。