关于员工入职时让填写家庭孩子信息是否合法的问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

首先，从法律层面来看，我国法律规定企业在招聘时不得询问与劳动合同无关的个人信息，特别是女性的婚育信息。这是因为这类信息属于个人隐私范畴，受到法律的保护。求职者有权利选择不填写或隐瞒这部分信息，而不必担心因此承担法律责任。

其次，从实际操作角度考虑，用人单位在招聘过程中主要关注的是求职者的工作能力、专业技能以及与岗位的匹配度。因此，要求填写家庭孩子信息等与劳动合同无直接关联的信息并不合理，也无助于评估求职者的实际工作表现。

再者，如果用人单位强行要求求职者填写这类信息，可能涉嫌对求职者的隐私侵犯，尤其是对女性求职者而言，更可能加剧就业歧视的风险。这种行为不仅违反了《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，还可能触犯《中华人民共和国妇女权益保障法》，需要承担相应的法律责任。

综上所述，员工入职时让填写家庭孩子信息是不合法的。求职者有权拒绝填写这类与劳动合同无关的个人信息，并可以向相关部门投诉或举报用人单位的违法行为。同时，用人单位也应该尊重求职者的隐私权和个人信息权益，避免在招聘过程中提出不合理的要求。