针对您提出的问题，关于在工程判决已生效后，被告发现还有材料未扣款是否能再起诉的问题，这里是我的详细解答：
结论前置：在判决已经生效的情况下，被告通常不能直接就同一工程再次起诉要求扣款，因为法院的判决是有法律效力的，必须履行。但如果发现有新的证据或情况，可以通过特定法律程序处理。
详细分析：
- 判决的效力：一旦法院的判决生效，它就具有了法律上的约束力。这意味着，原、被告双方都必须按照判决的内容来履行，包括支付款项、交付物品等。如果被告认为还有材料未扣款，但这部分内容并未在之前的判决中体现，那么被告不能直接就这部分内容再次起诉。
- 新的证据或情况：如果被告在判决生效后，发现了新的证据或情况，这些证据或情况能够证明原告在之前的诉讼中隐瞒了部分事实，或者能够证明被告确实还有未扣款的材料款项，那么被告可以考虑通过以下途径来维护自己的权益：
- 申请再审：根据《民事诉讼法》的相关规定，如果当事人有新的证据，足以推翻原判决、裁定的，可以向法院申请再审。但再审的启动有严格的条件和程序，需要当事人提供充分的证据来支持自己的申请。
- 另行起诉：在某些情况下，如果被告发现的新证据或情况与之前的诉讼不是同一法律关系，或者之前的诉讼并未涉及这部分内容，那么被告可以考虑另行起诉，要求原告支付未扣款的材料款项。但这种情况下，被告需要确保自己的起诉符合法院的受理条件，并且能够提供充分的证据来支持自己的主张。
- 法律建议：在处理这类问题时，我建议您首先仔细审查之前的判决内容，确认是否确实存在未扣款的材料款项。如果确实存在，并且您有新的证据或情况来支持自己的主张，那么您可以考虑咨询专业的律师，通过法律途径来维护自己的权益。
综上所述，被告在判决生效后发现还有材料未扣款，不能直接就同一工程再次起诉。但如果发现有新的证据或情况，可以通过申请再审或另行起诉等途径来处理。在处理这类问题时，建议您咨询专业的律师，以确保自己的权益得到充分的保护。