公司单方面停缴社保是不合法的。在雇员与公司尚未解除劳动关系的情况下，公司不能单方面擅自决定停止为雇员缴纳社会保险。这种行为明确违反了相关法律规定，雇员有权采取多种措施来维护自己的权益。

首先，如果公司单方面停缴了社保，雇员可以直接向当地劳动管理部门提出申诉。劳动行政部门会根据相关规定对此事进行严肃处理，包括但不限于责令公司做出整改、给予警告处罚。如果因为公司的这一行为给雇员带来了实际损失，公司还需要承担相对应的赔偿责任。

其次，雇员也可以通过法律途径来保障自己的权益不受侵犯。例如，依法申请进入仲裁程序，或者直接提起诉讼，要求公司恢复社保缴纳并赔偿因此造成的损失。

此外，需要明确的是，公司单方面停缴社保并不等同于辞退。辞退需要遵循法定的程序，并有明确的辞退通知或相关解除劳动合同的行为及法定事由。而停缴社保只是公司在社保缴纳方面的不当操作，但它并不直接构成辞退。

总的来说，公司单方面停缴社保是违法的，雇员有权采取多种措施来维护自己的合法权益。如果遇到这种情况，建议先与公司进行协商，要求补缴社保；如果协商不成，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的社保权益。