结论前置：在机关事业单位中，请事假是否要在年休假中扣除，需根据具体情况而定。一般情况下，事假和年休假是两种不同的假期类型，不应相互抵扣。但在特定情况下，如事假天数累计达到一定标准且单位不扣工资时，则可能会从年休假中扣除或影响当年的年休假权益。
一、年休假与事假的基本规定
年休假规定：
- 根据《职工带薪年休假条例》，机关、团体、企业、事业单位等单位的职工连续工作1年以上的，享受带薪年休假。
- 休假天数根据职工累计工作年限确定，如累计工作已满1年不满10年的，年休假5天等。
事假规定：
- 事假是职工因个人事务需要处理的假期，其请假天数和是否扣发工资由单位根据具体情况决定。
二、事假与年休假的关系
一般情况：
- 事假和年休假是两种不同的假期类型，通常情况下不应从年休假中扣除事假。
- 职工请事假时，单位应按规定处理事假期间的工资待遇，但不应直接抵扣年休假。
特殊情况：
- 根据《职工带薪年休假条例》第四条，职工请事假累计20天以上且单位按照规定不扣工资的，不享受当年的年休假。
- 若单位规章制度中有规定事假可以抵扣年休假的条款，需确保其制定程序合法且内容不违反法律法规的强制性规定。在此情况下，事假可能会按照规章制度抵扣年休假。
三、实际应用中的注意事项
- 职工在请事假时，应了解并遵守单位的相关规定，同时关注自己的年休假权益是否受到影响。
- 单位在处理事假与年休假的关系时，应基于法律法规和规章制度进行协商和处理，确保职工权益得到妥善维护。
四、具体示例
- 假设某机关事业单位职工累计工作已满1年不满10年，享有5天年休假。若该职工请事假10天，且单位未扣发工资，则这10天事假不会直接抵扣年休假。但若该职工请事假累计达到20天以上，且单位不扣工资，则该职工将不享受当年的年休假。
综上所述，机关事业单位请事假是否要在年休假中扣除，需根据具体情况和单位规定而定。职工在请事假时应了解相关规定，确保自己的年休假权益不受影响。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。