土地增值税约定由买受人承担是无效的。以下是对此结论的详细解释：

1. 法规依据：

   • 根据《中华人民共和国土地增值税暂行条例》第二条，转让国有土地使用权并取得收入的单位和个人，为土地增值税的纳税义务人，应当依照本条例缴纳土地增值税。
   • 《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》第三条也明确规定，纳税人应当依照税收法律、行政法规的规定履行纳税义务；其签订的合同、协议等与税收法律、行政法规相抵触的，一律无效。

2. 法理分析：

   • 土地增值税的纳税义务人是法定的，即转让国有土地使用权的单位和个人。这一规定是行政法规的强行性规定，不能通过合同或协议来改变。
   • 虽然合同当事人可以基于私法自治的原则，就土地增值税的承担进行约定，但这种约定仅在当事人之间产生效力，对外（如税务机关）并不产生法律效力。
   • 因此，即使合同中约定由买受人承担土地增值税，税务机关仍然会向法定的纳税义务人（即转让方）征缴税款。如果买受人未按照约定缴纳税款，转让方仍需承担纳税责任。

3. 实际操作：

   • 在实际操作中，如果买卖双方约定由买受人承担土地增值税，建议明确约定买受人需以转让方的名义向税务机关缴纳税款，并确保税款能够按时足额缴纳。
   • 同时，转让方也应保留好相关证据，以证明税款已由买受人实际承担，避免未来可能出现的纠纷。

综上所述，土地增值税约定由买受人承担是无效的，因为纳税义务人是法定的，不能通过合同或协议来改变。在实际操作中，建议买卖双方明确约定税款的缴纳方式和责任，以避免未来可能出现的纠纷。如有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。