关于“施工单位进度滞后罚款单由谁出具”的问题，这通常取决于具体的合同约定以及项目管理的实际情况。以下是我的详细分析：

1. 根据合同约定：

   • 在大多数建设工程施工合同中，会明确约定施工进度、滞后罚款的相关条款，以及罚款单的出具主体。
   • 如果合同中有明确规定，那么应按照合同约定的程序和主体来出具罚款单。例如，可能是由发包方（如建设单位或业主）的项目管理部门，或者是双方共同指定的第三方监管机构来出具。

2. 根据项目管理实际情况：

   • 在没有具体合同约定的情况下，罚款单的出具主体可能会根据项目的实际管理模式和双方协商来确定。
   • 如果项目中有专门的监理机构或项目管理公司，他们可能会负责监督施工进度，并在施工单位进度滞后时出具罚款单。
   • 如果没有专门的监理或管理机构，那么发包方和承包方（施工单位）可能需要通过协商来确定罚款单的出具主体和程序。

综上所述，施工单位进度滞后罚款单的出具主体并不是固定的，而是需要根据具体的合同约定和项目管理的实际情况来确定。如果你在这方面遇到了具体的问题或纠纷，可以详细向我说明情况，我会根据你的实际情况给出更具体的法律建议。