当单位只交了意外险，发生工伤事故时，工伤赔偿主要由工伤保险基金承担，若意外险合同涵盖工伤责任，则保险公司也需按约定赔付。具体分析如下：
工伤保险基金承担主要赔付责任：
- 单位为员工缴纳的工伤保险是法定强制保险，用于保障员工在工作时间、工作场所内及其他法定情形下的工伤赔偿。
- 发生工伤事故后，单位应及时申报工伤认定。认定为工伤后，工伤保险基金将承担主要赔付责任，包括医疗费用（符合工伤保险诊疗项目目录等的费用）、一次性伤残补助金等。
意外险的赔付需看合同约定：
- 单位为员工购买的意外险是商业保险，其赔付范围和标准依据保险合同的约定。
- 若意外险合同明确涵盖工伤责任，且员工在获得工伤保险赔付后，仍可根据合同要求保险公司按约定进行赔付，如伤残津贴等。
法律建议：
- 员工在发生工伤事故后，应积极配合单位进行工伤认定和保险赔付事宜的申请。
- 保留与工作相关的证据，如劳动合同、考勤记录、事故现场照片、医疗诊断证明等，以证明工伤事实和伤害程度。
- 仔细研读意外险的保险合同，明确保险责任、赔付范围、免责条款等内容，确保自身索赔符合规定。
- 若在赔付过程中遇到纠纷，可与单位和保险公司积极沟通协商。若协商不成，可通过劳动仲裁或诉讼途径解决。
综上所述，当单位只交了意外险而发生工伤事故时，员工应首先通过工伤保险基金获得主要赔付。同时，若意外险合同涵盖工伤责任，员工还可依据合同要求保险公司进行赔付。在整个过程中，员工应积极配合并保留相关证据，以确保自身权益得到保障。