迟到是否会扣全勤，主要取决于用人单位的规章制度以及劳动合同中的相关约定。以下是对此问题的详细分析：

1. 规章制度与劳动合同约定：

   • 若用人单位的规章制度或劳动合同中明确规定，迟到将影响全勤奖的发放，且该规定已经过法定的民主程序制定并公示，那么用人单位有权按照约定扣除全勤奖。
   • 若规章制度或劳动合同中未对迟到与全勤奖的关系作出明确规定，或者规定模糊不清，用人单位则不能随意以迟到为由扣除全勤奖。

2. 规章制度的合理性：

   • 用人单位在制定涉及劳动者切身利益的规章制度时，应确保其内容的合法性和合理性。例如，不能将轻微迟到视为严重违规并扣除全勤奖，这样的规定可能会被认定为无效。
   • 规章制度的制定应遵循公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则，且应经过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定。

3. 实际操作的灵活性：

   • 在实际操作中，用人单位应考虑迟到的具体情形。对于偶尔迟到且有合理原因（如突发交通意外、身体不适等）的员工，可以酌情考虑不扣除全勤奖，以体现人性化管理。
   • 对于经常迟到且无正当理由的员工，用人单位扣除全勤奖是合理的，这既是对遵守纪律员工的公平对待，也是维护正常工作秩序的必要措施。

4. 员工的权益保护：

   • 如果员工认为用人单位扣除全勤奖的做法不合理或不合法，首先应与用人单位进行沟通协商，要求其说明扣奖依据。
   • 若协商不成，员工可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

综上所述，迟到是否扣全勤是一个综合考量的问题，既需要依据用人单位的规章制度和劳动合同的约定，也需要考虑规章制度的合理性和实际操作的灵活性。因此，无法给出一个统一的答案，而是需要根据具体情况来判断。如果你在这方面有具体的疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。