加工方发票已开且委托方已认证，并不能直接认定双方存在合同关系。具体分析如下：

1. 从发票的法律性质来看：发票是交易双方的收付款凭证，也是纳税人经济活动的重要商事凭证，但它本身并不直接等同于合同。发票的开具和认证主要关注的是交易行为的税收处理，而非交易双方具体的权利义务关系。

2. 从合同关系的构成来看：合同关系的存在需要双方有明确的合同意思表示，即双方就合同的主要条款达成一致，并形成书面或口头的合同。仅凭发票的开具和认证，并不能证明双方有明确的合同意思表示，也不能证明双方就合同的主要条款达成了一致。

3. 从法律实践来看：在实际的法律纠纷中，法院或仲裁机构在判断双方是否存在合同关系时，会综合考虑多种证据，如合同文本、交易习惯、双方的行为等。发票虽然可以作为交易行为的证据之一，但并不能单独作为认定合同关系的依据。

综上所述，加工方发票已开且委托方已认证，并不能直接认定双方存在合同关系。如需进一步确认双方是否存在合同关系，还需要结合其他证据进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。