仅凭单位否定与另一单位有买卖关系但仍开具发票这一行为，不能直接认定双方存在真实的买卖关系，但该发票可以作为证明买卖关系存在的重要证据之一，需结合其他证据综合判断。以下从不同角度进行分析：

从发票的法律性质角度

发票是在购销商品、提供或者接受服务以及从事其他经营活动中，开具、收取的收付款凭证。根据相关法律规定及税务实践，发票本身是交易的一种书面证明，但它并不具有绝对的证明力，不能单独作为认定买卖关系存在的唯一依据。因为存在一些特殊情况，比如虚开发票等违法行为，此时发票所记载的内容与实际的交易情况并不相符。所以，虽然单位开具了发票，但不能仅仅依据此就认定存在真实的买卖关系。

从证据的证明力角度

在民事诉讼中，证据需要满足真实性、合法性和关联性的要求。发票作为书证，具有一定的证明力，但要证明买卖关系的真实存在，还需要其他证据与之相互印证。例如：

• 合同：如果双方签订了书面买卖合同，合同中明确约定了买卖的标的、数量、价格、交货方式等条款，那么合同就是证明买卖关系存在的重要直接证据。结合发票，可以更有力地证明双方之间存在真实的交易。
• 送货单、收货单：这些单据可以证明货物的实际交付情况。如果送货单或收货单上有双方的签字确认，能够与发票相互佐证，进一步增强证明买卖关系真实存在的力度。
• 付款凭证：如银行转账记录、现金收据等，可以证明买方已经按照约定支付了货款。付款凭证与发票相结合，也能从资金流转的角度证明买卖关系的存在。

从单位否定买卖关系的情况分析

如果单位否定与另一单位存在买卖关系，那么需要审查其否定的理由是否合理合法。例如：

• 是否存在虚开发票行为：如果单位是为了套取资金、逃避税收等非法目的而虚开发票，那么这种发票不能作为认定真实买卖关系的依据。此时，需要税务机关等相关部门进行调查核实，确定是否存在虚开发票的违法行为。
• 是否存在其他法律关系：单位之间可能存在其他法律关系，如借贷、赠与等，而误开了发票。在这种情况下，需要结合具体的法律关系和相关的证据来判断，不能仅仅依据发票就认定存在买卖关系。

法律建议

• 对于主张存在买卖关系的一方：应当积极收集其他相关证据，如上述提到的合同、送货单、付款凭证等，与发票一起形成完整的证据链，以证明买卖关系的真实存在。
• 对于否定买卖关系的一方：需要提供充分的证据来支持自己的主张，如证明发票是虚开的、存在其他法律关系等。同时，要积极配合相关部门的调查，说明情况。

如果双方就此问题产生纠纷，无法协商解决，可以通过诉讼或仲裁等法律途径来解决。在诉讼或仲裁过程中，法院或仲裁机构会根据双方提供的证据，综合判断买卖关系是否真实存在。如果你还有其他关于金融保险（税务及发票）方面的疑问，或者需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。