公司赔偿金打款备注工资不合法。下面我将对此进行详细分析：

一. 赔偿金与工资的法律性质不同

1. 赔偿金定义：赔偿金通常是由于公司违反合同或法律规定，对员工造成损失而给予的补偿。它是对员工损失的一种弥补，具有明确的法律性质。
2. 工资定义：工资是员工为公司提供劳动服务所应得的报酬，是员工劳动价值的体现。工资与赔偿金在性质、目的和法律依据上都有明显的区别。

二. 备注工资可能引发的法律后果

1. 误导员工：如果公司赔偿金打款备注为工资，可能会误导员工认为这笔款项是工资的一部分，从而忽略了赔偿金的真正性质。
2. 税务问题：赔偿金和工资在税务处理上也有所不同。如果赔偿金被错误地备注为工资，可能会导致税务处理上的混乱，甚至可能引发税务纠纷。
3. 法律证据问题：在发生劳动争议时，备注为工资的赔偿金可能会成为公司逃避法律责任的借口，对员工维权造成不利影响。

三. 正确的做法

1. 明确备注：公司在打款时，应该明确备注款项的性质，如“赔偿金”、“补偿金”等，以区分于工资。
2. 遵守法律规定：公司应该遵守相关法律法规，确保赔偿金的支付符合法律规定，避免引发不必要的法律纠纷。

综上所述，公司赔偿金打款备注工资是不合法的。这种做法不仅可能误导员工，还可能引发税务和法律证据问题。我建议公司在支付赔偿金时，务必明确备注款项的性质，以确保合法合规。如有进一步需要，您可以继续咨询我。