工厂每天安排员工工作12小时，在特定条件下可能不违法，但关键在于是否严格遵守了《中华人民共和国劳动法》及其实施条例的相关规定。以下是对此问题的详细分析：
一. 工厂每天工作12小时可能不违法的条件
协商一致与加班限制：根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，国家实行劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时的工时制度。然而，在生产经营需要的情况下，经与工会和劳动者协商后，可以延长工作时间，但一般每日不得超过3小时，且每月不得超过36小时。如果工厂在遵循这一规定的前提下，与员工协商一致，且加班时间未超过法定限制，那么安排员工每天工作12小时可能不违法。
特殊行业或岗位的规定：对于某些特殊行业或岗位，如交通、铁路、邮电、航空、渔业等，由于其工作性质和生产特点的特殊性，可能无法严格按标准工作时间执行。这些行业或岗位可以申请不定时工作制或综合计算工时工作制，但需经劳动行政部门批准。如果工厂属于这些特殊行业或岗位，并且已经获得了相应的批准，那么安排员工每天工作12小时也可能不违法。
二. 违法行为的法律后果
如果工厂未经协商、未支付相应加班工资，或不符合特殊行业相关规定而安排员工工作12小时，那么将违反《中华人民共和国劳动法》的规定。员工有权向劳动监察部门投诉举报，或通过劳动争议仲裁机构维护自己的合法权益。工厂将可能面临行政处罚、支付赔偿金等法律后果。
三. 总结与建议
工厂在安排员工工作时，应严格遵守劳动法的规定，确保劳动者的合法权益得到保障。同时，员工也应了解自己的权益，遇到违法行为时及时寻求法律援助。我建议工厂在安排员工加班时，务必与员工协商一致，并确保加班时间不超过法定限制，同时依法支付加班工资。对于特殊行业或岗位，应事先申请并获得劳动行政部门的批准。