结论前置：在一般情况下，工厂安排员工每日上班12小时是违法的，除非符合特定条件并经过合法审批。
详细分析如下：
一、一般情况下的违法性
根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条的规定，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。这是保障劳动者休息权益、维护劳动者身体健康的重要法律基础。如果工厂安排员工每日上班12小时，明显超出了这一法定工作时间限制，因此，在一般情况下，这种行为是违法的。
二、特殊情况下的合法性
虽然一般情况下上班12小时是违法的，但在某些特殊情况下，可能不构成违法。这些特殊情况主要包括：
不定时工作制：
- 适用于因工作性质、特点或职责限制无法按标准工作时间衡量的职工，如高级管理人员、外勤人员等。
- 在此制度下，上班12小时不一定违法，但需确保职工整体工作时间和休息权益得到保障，且需经过劳动行政部门的审批。
综合计算工时工作制：
- 以周、月、季、年为周期综合计算工作时间，但平均日工作时间和周工作时间应与法定标准基本相同。
- 在综合计算周期内，某一日（或周）实际工作时间可超过8小时（或40小时），但总实际工作时间不应超过总法定标准工作时间。超过部分需按加班处理并支付加班工资。
- 如果工厂实行综合计算工时工作制，并经过劳动行政部门的审批，且确保劳动者的整体工作时间和休息权益得到保障，那么安排员工上班12小时可能不构成违法。
依法延长工作时间：
- 根据《劳动法》第四十一条，用人单位因生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可延长工作时间，一般每日不得超过1小时；特殊原因下延长工作时间每日不得超过3小时，每月不得超过36小时。
- 在这些情况下，如果工厂与工会和劳动者协商一致，并依法支付加班工资，则安排劳动者上班12小时可能是合法的，但这种情况应当非常罕见且需有充分理由。
三、法律后果与劳动者权益保护
如果工厂未经审批延长劳动者工作时间超出法定限制，属于违反劳动法的行为。劳动者有权要求工厂改正违法行为，并支付相应的加班工资及经济补偿。具体来说：
加班工资支付标准：
- 工作日加班需支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
- 休息日加班应先安排补休，不能安排补休的需支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
- 法定节假日加班需支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
维权途径：
- 劳动者可以向当地劳动监察部门提出投诉，请求其对工厂的违法行为进行查处；
- 劳动者还可以通过劳动仲裁委员会提起劳动仲裁，要求工厂支付加班工资、经济补偿等应得权益。
总结与建议：工厂安排员工每日上班12小时在一般情况下是违法的，除非符合特定条件并经过合法审批。作为劳动者，如果面临这种情况，应勇敢站出来维护自己的合法权益。可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的权益。同时，也建议工厂遵守劳动法律法规，合理安排劳动者的工作时间，确保劳动者的休息权益和身体健康得到保障。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。