您好，关于您提出的“上班途中发生交通事故，对方只赔偿了医疗费，其余部分工伤保险是否可以赔偿”的问题，以下是我的详细解答：

首先，需要明确的是，工伤保险与交通事故赔偿是两个不同的法律关系，它们之间并不冲突，也不互相排斥。在我国，职工在上班途中发生交通事故，如果被认定为工伤，那么职工有权同时要求侵权赔偿和工伤待遇。

关于您提到的医疗费用，如果对方已经进行了赔偿，那么工伤保险在医疗费用方面通常只会补偿差额部分，即实际医疗费用与对方赔偿金额之间的差额。这是因为医疗费用不能重复主张，避免您获得双重赔偿。

然而，除了医疗费用之外，工伤保险还可以赔偿其他与工伤相关的费用，如误工费（停工留薪期间的工资）、住院伙食补助费、护理费、伤残补助金等。这些费用是根据您的工伤认定和伤残等级来确定的，与交通事故的赔偿是独立的。

因此，即使对方只赔偿了医疗费用，您仍然有权向工伤保险机构申请其他与工伤相关的赔偿。您需要准备好相关的工伤认定材料、医疗费用单据、伤残等级鉴定书等，以便工伤保险机构进行核算和赔偿。

最后，需要提醒的是，工伤保险的赔偿流程和所需材料可能因地区和具体政策而有所不同。建议您咨询当地的工伤保险机构或相关部门，以获取更具体和准确的赔偿信息和流程指导。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。