当企业总部搬迁遇到三期员工（通常指处于孕期、产期、哺乳期的女性员工）时，处理方式需要格外谨慎，以确保符合相关法律法规，并体现出企业对员工的关怀与尊重。以下是我作为律师给出的详细建议：

1. 明确法律法规底线：

   • 根据《劳动法》、《劳动合同法》及《女职工劳动保护特别规定》等法律法规，三期员工享有特殊的劳动保护，如不得随意解除劳动合同、应提供适合的劳动条件等。
   • 搬迁过程中，应确保三期员工的工作地点、工作环境及薪资待遇等不受负面影响。

2. 沟通与协商：

   • 提前与三期员工进行深入的沟通，了解她们的需求和担忧，解释搬迁的必然性和必要性。
   • 尝试通过协商达成共识，比如提供灵活的通勤方式、调整工作时间或工作地点等，以减轻搬迁对她们生活和工作的影响。

3. 制定个性化方案：

   • 针对每位三期员工的具体情况，制定个性化的搬迁方案。
   • 如有可能，可考虑为她们提供临时住宿或通勤补贴等实际帮助。

4. 确保工作连续性：

   • 在搬迁过程中，应确保三期员工的工作连续性不受影响，避免因搬迁导致的工作中断或降低工作效率。
   • 可安排专人协助她们完成搬迁前后的工作交接，确保工作平稳过渡。

5. 关注员工心理健康：

   • 搬迁对于员工来说可能是一个较大的变动，特别是对于三期员工而言，更可能带来额外的心理压力。
   • 企业应关注她们的心理健康状况，提供必要的心理支持和辅导。

6. 建立反馈机制：

   • 设立专门的反馈渠道，让三期员工在搬迁过程中能够随时反映问题和困难。
   • 对员工的反馈应及时响应并妥善处理，确保员工的合理诉求得到满足。

综上所述，企业总部搬迁时遇到三期员工，应严格遵守相关法律法规，通过沟通与协商、制定个性化方案、确保工作连续性、关注员工心理健康以及建立反馈机制等措施，来妥善处理这一问题。如有任何具体法律疑问或需要进一步的法律支持，请随时向我咨询。