在商铺租房合同中约定税额由承租方承担，并不违反法律的强制性规定，因此是合法的。但承租方不能因此拒绝付款。

1. 合法性分析：

   • 根据税收相关法律法规，税款的缴纳义务通常基于税法规定，而非基于合同双方的约定。但在实际商业活动中，合同双方可以约定税款的承担方式。
   • 商铺租房合同中约定税额由承租方承担，属于合同双方自愿达成的协议，不违反法律的强制性规定，因此具有法律效力。

2. 承租方付款义务：

   • 承租方在签订合同时，应当充分了解并接受合同中的所有条款，包括税额承担条款。
   • 如果承租方在合同生效后拒绝付款，将构成违约行为，出租方有权根据合同约定追究承租方的违约责任。

3. 建议与注意事项：

   • 在签订商铺租房合同时，双方应明确约定税额的具体承担方式、金额及支付方式等细节，以避免后续产生争议。
   • 承租方在签订合同前应仔细审查合同条款，确保自身权益不受损害。
   • 如果承租方对税额承担条款有异议，可以与出租方进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。

综上所述，商铺租房合同中约定税额由承租方承担是合法的，承租方不能因此拒绝付款。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。