基本公共卫生服务资金直接给卫生院职工发工资打卡是违法的，具体违法处罚需根据实际情况确定。

首先，基本公共卫生服务资金是专项用于提供基本公共卫生服务的，其使用和管理应严格遵守相关法律法规和财务规定。将这笔资金直接用于给卫生院职工发工资，显然违反了资金的使用目的和规定。

其次，关于违法处罚，这主要取决于违规行为的严重程度、造成的后果以及相关法律法规的具体规定。一般来说，单位违规使用资金，可能会面临以下一种或多种处罚：

1. 行政处罚：相关监管部门可能会对单位进行罚款、警告等行政处罚，并责令其改正违规行为。
2. 刑事责任：如果违规行为构成犯罪，如贪污、挪用公款等，那么相关责任人可能会面临刑事处罚。
3. 民事赔偿：如果违规行为导致劳动者权益受损，如未按时足额支付劳动报酬，那么单位可能需要承担民事赔偿责任。

此外，对于直接参与或负责违规行为的个人，如出纳、财务负责人等，也可能会根据其责任大小面临相应的法律责任，包括但不限于行政处罚、刑事责任以及因违反会计法规或劳动合同法而导致的责任。

综上所述，基本公共卫生服务资金直接给卫生院职工发工资打卡是违法的，单位和个人都应严格遵守相关法律法规和财务规定，确保资金的合规使用。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。