关于“涉密部门离职后是否归还员工护照”的问题，首先我们需要明确一点：员工护照是员工的个人身份证件，无论员工在哪个部门工作，离职时都应归还给员工。下面我将从几个方面详细解释这一观点。

1. 护照的性质：

   • 护照是公民出入国境和在国外证明国籍和身份的证件，属于个人所有，任何单位或个人无权长期扣留。

2. 涉密部门的管理要求：

   • 涉密部门确实对员工的保密义务有更高要求，但这并不意味着可以扣留员工的护照。
   • 涉密部门应通过签订保密协议、进行保密教育等方式来管理员工的保密行为，而不是通过扣留护照这种非法手段。

3. 离职后的处理：

   • 员工离职时，用人单位应按照法律规定和双方约定，办理离职手续，包括归还员工的个人物品，如护照。
   • 如果用人单位无故扣留员工护照，员工有权向相关部门投诉或寻求法律援助。

4. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国护照法》等相关法律法规，任何组织或者个人不得非法扣押他人的护照。

综上所述，涉密部门离职后，用人单位应归还员工的护照。如果用人单位拒绝归还，员工可以依法维护自己的权益。如果你在这方面遇到任何问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。