扣除社保后工资低于当地最低工资标准是不合法的。以下是对这一问题的详细解答：

一、最低工资标准的定义

最低工资标准是指劳动者在法定工作时间或依法签订的劳动合同约定的工作时间内提供了正常劳动的前提下，用人单位依法应支付的最低劳动报酬。这一标准包含了个人缴纳的社会保险费等在内的应得工资，是劳动者提供正常劳动后应获得的最低报酬保障。

二、扣除社保后工资低于最低工资标准的情形分析

1. 扣除个人应缴纳社保部分后低于最低标准：

   • 根据相关规定，用人单位支付给劳动者的工资，在剔除延长工作时间工资、特殊工作环境下的津贴以及法律、法规和国家规定的劳动者福利待遇等后，不得低于当地最低工资标准。这里的“剔除”并不包括个人应缴纳的社会保险费。
   • 实例说明：若当地最低工资标准为每月2000元，员工月工资为2200元，扣除个人社保应缴纳的300元后，实际到手工资为1900元，这是不合法的，因为实际到手工资低于了最低工资标准。

2. 扣除单位应缴纳社保部分后低于最低标准：

   • 社保费用由单位和个人共同承担，单位有义务按照规定为员工缴纳社保，且这部分费用不能从员工工资中扣除。如果单位将本应由其承担的社保费用转嫁给员工，导致员工工资低于最低工资标准，这不仅违反了最低工资标准的相关规定，也违反了社会保险法的相关规定。

三、处理办法与建议

1. 与用人单位沟通：劳动者发现工资问题后，应首先与用人单位进行沟通，要求其按照法律规定支付工资，并补足差额部分。

2. 向劳动监察部门投诉：如果与用人单位的沟通协商没有结果，劳动者可以向当地的劳动监察部门进行投诉。投诉时，应准备好相关证据，如劳动合同、工资条、社保缴费记录等。

3. 申请劳动仲裁：如果劳动者对劳动监察部门的处理结果不满意，或者希望更直接地解决争议，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁裁决具有法律效力，双方都应履行。

4. 了解当地规定：劳动者还需要了解所在地区关于最低工资标准的具体规定，特别是关于社保费用是否包含在最低工资标准内的规定。这可以通过查询当地人力资源和社会保障部门的官方网站或咨询热线来获取准确信息。

综上所述，扣除社保后工资低于最低工资标准是不合法的行为。劳动者应了解自己的权益，并在必要时采取法律手段来维护自己的合法权益。同时，用人单位也应自觉遵守相关法律法规，确保劳动者的合法权益不受侵害。