个人所得税的计算是基于应发工资来进行的，而非实发工资。以下是对此问题的详细解答：

一、应发工资与实发工资的概念区分

• 应发工资：这是指劳动者在提供正常劳动后，用人单位应当支付的全部报酬。它包括了基本工资、奖金、津贴、补贴等各项收入，是扣除任何款项之前的工资总额。
• 实发工资：这是劳动者实际到手的工资，它是应发工资在扣除个人所得税、社保个人缴纳部分、住房公积金个人缴纳部分等扣款后的金额。

二、个人所得税的计算依据

根据《中华人民共和国个人所得税法》的规定，居民个人的综合所得，是以每一纳税年度的收入额（通常是基于应发工资）为基础，减除费用六万元（或每月减除费用五千元，根据具体情况而定）、专项扣除、专项附加扣除以及依法确定的其他扣除后的余额，作为应纳税所得额。这个应纳税所得额就是计算个人所得税的依据。

三、具体计算过程

以一个小张的例子来说明个人所得税的计算过程：

• 假设小张某月的应发工资为10000元。
• 在计算个人所得税时，首先需要从这个应发工资中减除一系列的费用和扣除项，比如每月减除费用5000元、社保个人缴纳部分1000元、住房公积金个人缴纳部分500元，以及如果小张有一个子女正在接受全日制学历教育，那么他还可以享受每月1000元的专项附加扣除。
• 经过这些扣除后，小张的应纳税所得额就是：应发工资10000元 - 每月减除费用5000元 - 社保个人缴纳1000元 - 住房公积金500元 - 专项附加扣除1000元 = 2500元。
• 最后，根据这个应纳税所得额和相应的税率、速算扣除数，就可以计算出小张当月应纳的个人所得税。

综上所述，个人所得税的计算是基于应发工资来进行的，而不是实发工资。在处理税务相关事宜时，我们应该对应发工资有准确的理解，并合理应用税法规定的各项扣除，以准确计算应纳税所得额，从而合法合规地缴纳个人所得税。