工资薪金扣除社保通常是应发薪金中进行扣除。下面我来详细解释一下：

1. 应发薪金与实发薪金的概念：

   • 应发薪金：是指员工在扣除任何税前和社保等费用之前的薪金总额。
   • 实发薪金：是指员工实际到手，已经扣除了税款、社保等费用后的薪金。

2. 社保扣除的时机：

   • 社保费用通常是在计算应发薪金时就进行扣除的，而不是在实发薪金中扣除。这意味着，在计算员工应缴纳的社保费用时，是基于其应发薪金来确定的。

3. 实际操作中的体现：

   • 在工资条上，你通常会看到应发薪金、扣除项（包括社保、税款等）以及实发薪金。社保费用作为扣除项之一，是在应发薪金中直接扣除的，最终得到的才是实发薪金。

综上所述，工资薪金扣除社保是在应发薪金中进行的。如果你还有其他关于工资薪金或社保的问题，欢迎随时向我咨询。