结论前置：补偿金不合理但已签字，仍然有可能通过仲裁寻求合理调整，不过这取决于协议签订时的具体情况及后续的法律操作。以下从不同角度为你详细分析：

一、可以申请仲裁的情形

1. 存在可撤销情形
   • 重大误解：假如在签署补偿协议时，你对关键内容，比如补偿金的计算方式、包含的项目等存在重大误解，导致最终拿到的补偿不合理。例如，你本应获得包含加班费、奖金等在内的补偿金，但因误解只拿到了基本工资的补偿，这种情况下，根据《中华人民共和国民法典》相关规定，你可以申请撤销该协议，然后重新确定合理的补偿金额。
   • 显失公平：要是协议内容明显偏向一方，使得双方权利义务严重失衡。比如，公司利用你急于离职的心理，给出的补偿金远远低于法定标准，而你又因为各种原因签署了协议，此时处于不利地位的你就有权申请仲裁。
   • 欺诈、胁迫或乘人之危：在签署协议过程中，若你受到公司的欺诈、胁迫，或者公司利用你当时面临的困境（如家庭突发重大变故急需用钱等）迫使你签约，那么你作为受损害方有权撤销协议并申请仲裁。例如，公司谎称如果不签署这份不合理的补偿协议，就会在离职证明上写不利于你的内容，影响你后续找工作，你因此签署了协议，这就属于受胁迫签约。
2. 协议内容违法：如果补偿协议违反了法律法规的强制性规定，那么该协议是无效的。比如，协议中约定的补偿金低于当地最低工资标准，这种情况下，你当然可以就争议事项向仲裁机构申请仲裁。
3. 协议履行过程中的违约：若协议签订后，公司违反约定，比如没有按照协议约定的时间和方式支付补偿金，你可以根据协议中的仲裁条款（如果有）提起仲裁，要求公司履行协议或者承担违约责任。

二、可能面临的不利因素

1. 协议的法律效力：如果协议是双方真实意思表示，内容合法且不存在上述可撤销情形，那么该协议具有法律效力。此时，仲裁机构可能会认定双方应当依约履行，驳回你调整补偿金的请求。例如，你在签署协议前，公司已经明确告知了补偿金的计算方式和标准，你也表示认可并签字，之后又觉得补偿不合理申请仲裁，这种情况下就可能不被支持。
2. 举证困难：要证明协议存在重大误解、显失公平、欺诈、胁迫或乘人之危等情形，需要提供充分的证据。如果证据不足，仲裁机构可能无法支持你重新确定补偿金的请求。比如，你说自己是在受胁迫的情况下签署的协议，但没有留下任何相关的录音、聊天记录等证据，那么就很难证明你的主张。
3. 放弃仲裁权利：如果协议中明确约定了双方放弃仲裁解决争议的权利，且该约定合法有效，那么你可能无法再就补偿金问题申请仲裁。

三、建议与操作指南

1. 仔细审查协议条款：在签订补偿协议前，一定要详细阅读并理解所有条款，特别是关于补偿金数额和支付方式的约定。如果有不明白的地方，要及时向公司询问清楚。
2. 及时行使撤销权：一旦发现协议存在可撤销情形，要在知道或应当知道撤销事由之日起一年内行使撤销权。超过这个期限，撤销权就会消灭。
3. 积极收集证据：为支持你的仲裁请求，要积极收集并保存所有相关证据，包括书面文件（如协议、工资条等）、通信记录（如微信聊天记录、邮件等）、证人证言等。

总之，补偿金不合理但已签字是否能仲裁，需要综合考虑多种因素。如果你遇到这种情况，不要慌张，可以向我详细描述协议签订的具体情况，我会为你提供更具体的法律建议。