工厂安排员工工作12小时是否违法，不能一概而论，关键在于是否遵循了《中华人民共和国劳动法》及相关法律法规的规定。以下是对此问题的全面分析：

1. 一般情况下，工厂安排员工工作12小时可能违法

   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时的工时制度。同时，该法第四十一条规定，因生产经营需要延长工作时间的，需与工会和劳动者协商，且一般每日不得超过1小时；特殊原因下延长工作时间每日不得超过3小时，但每月不得超过36小时。
   • 分析：若工厂未经协商、未支付相应加班工资，或不符合特殊行业相关规定而安排员工工作12小时，则明显超出了法律规定的正常工作时间和加班时长限制，构成了对劳动者合法权益的侵害，属于违法行为。

2. 特殊情况下，工厂安排员工工作12小时可能不违法

   • 协商一致且符合加班时间限制：工厂因生产经营的临时性、季节性需要，在与工会和劳动者协商后，可安排每日工作12小时，但需确保加班时间不超过法定限制（每日不超过3小时，每月不超过36小时），并依法支付加班工资（平时加班支付不低于工资的150%的工资报酬；休息日加班应先安排补休，不能安排补休的需支付不低于工资的200%的工资报酬；法定节假日加班需支付不低于工资的300%的工资报酬）。
   • 特殊行业或工作岗位的例外规定：对于交通、铁路、邮电、航空、渔业等特殊行业，因其工作性质和生产特点的特殊性，可能无法严格按标准工作时间执行。这些行业可申请不定时工作制或综合计算工时工作制，但需经劳动行政部门批准。例如，航空公司飞行员因航班任务不确定性，难以按标准8小时工作制执行。经劳动行政部门批准后，实行不定时工作制，飞行员根据航班任务安排工作12小时，则为合法。

3. 工厂违法安排员工工作12小时的法律后果

   • 用人单位的责任：如果用人单位未经审批延长劳动者工作时间超出法定限制，属于违反劳动法的行为。用人单位应依法支付加班费，并可能面临劳动监察部门的行政处罚。
   • 劳动者的权益保护：员工有权向劳动监察部门投诉举报，或通过劳动争议仲裁机构维护自己的合法权益。在投诉或仲裁过程中，员工应提供相关证据，如工作记录、加班通知、工资条等，以证明工厂的违法行为。

4. 建议与总结

   • 工厂应严格遵守劳动法规定：在安排员工工作时，应充分考虑工作时间的合理性、加班的协商与补偿机制，以及特殊行业的特殊规定。确保劳动者的合法权益得到保障，避免因违法行为而面临法律风险和声誉损失。
   • 员工应了解自己的权益：在面对工厂的违法行为时，员工应勇敢站出来，通过法律途径维护自己的合法权益。同时，员工也应保留好相关证据，以便在投诉或仲裁过程中证明自己的主张。

总之，工厂安排员工工作12小时是否违法，取决于是否遵循了劳动法的相关规定。在遇到此类问题时，建议员工先与工厂协商解决；协商不成的，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。