关于辞去科长职务后能否保留待遇的问题，这主要取决于具体的单位规定、劳动合同或相关政策文件，无法一概而论，但我可以从几个常见角度为你分析：
单位内部规定：
- 许多单位会有明确的职务与待遇挂钩的规定。如果你辞去科长职务，但单位规定中并未明确说明辞去职务后待遇会相应调整，那么理论上你有可能继续享受原有的待遇。
- 然而，如果单位规定中明确指出辞去职务将导致待遇降低或取消，那么你就需要接受这一结果。
劳动合同或聘用协议：
- 劳动合同或聘用协议中通常会明确约定你的职务、工作内容以及相应的待遇。如果你辞去科长职务，且这一变更得到了单位的同意，那么你需要仔细审查合同或协议中关于待遇变更的条款。
- 如果合同或协议中没有明确规定辞去职务后的待遇问题，或者规定较为模糊，那么你可能需要与单位进行协商，以达成一致意见。
相关政策文件：
- 某些行业或地区可能有特定的政策文件，对职务变更后的待遇问题进行规范。你可以查阅相关政策文件，了解是否有关于辞去科长职务后待遇保留的具体规定。
实际操作中的灵活性：
- 在实际操作中，单位可能出于多种考虑（如激励员工、保持团队稳定等），对辞去职务的员工在待遇上给予一定的灵活性。例如，单位可能允许你保留部分或全部原有待遇，但要求你承担新的工作职责或任务。
建议：
- 在决定辞去科长职务前，建议你先仔细审查单位规定、劳动合同或聘用协议以及相关政策文件，了解辞去职务后可能面临的待遇变化。
- 如果你对待遇问题存在疑虑或担忧，可以与单位的人力资源部门或相关负责人进行沟通，明确询问辞去职务后的待遇情况。
- 如果单位无法给出明确的答复或你与单位在待遇问题上存在分歧，你可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。
最后需要强调的是，劳动法律问题往往涉及复杂的法律条款和实际情况，因此我的分析只能作为一般性的参考。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。