针对您提出的“在公司申请的专利辞职后怎么办”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、专利归属的判断
首先，我们需要明确该专利是否为职务发明。根据《中华人民共和国专利法》的相关规定，职务发明创造主要包括以下几种情况：
在本职工作中作出的发明创造：如果您在公司的工作职责中明确包含了研发或创新任务，且该专利是在履行这些职责过程中完成的，那么它很可能被视为职务发明。
履行公司交付的本职工作之外的任务所作出的发明创造：即使该任务不在您的常规工作职责范围内，但如果是公司明确交付给您的，并且您在完成该任务过程中创造了专利，那么这也属于职务发明。
离职后1年内作出的与原单位工作相关的发明创造：如果您在离职后1年内，基于在原单位承担的本职工作或分配的任务，作出了相关的发明创造，这同样被视为职务发明。
职务发明创造的专利权归公司所有，申请被批准后，公司为专利权人。因此，即使您离职，该专利的归属也不会发生改变。
非职务发明创造则是指与您在原单位的工作无关，且是在离职后独立完成的发明创造。这种情况下，专利权归您个人所有。
此外，如果您与公司签订了合同，对申请专利的权利和专利权的归属作出了特别约定，那么应按照合同约定执行。
二、离职时的沟通与处理
告知公司：在办理离职手续时，您应明确告知公司关于该专利的相关事宜，包括专利的情况、后续可能的使用等。这有助于公司了解专利的归属和后续处理方式。
签订协议：为了保障双方权益，您可以与公司协商签订相关协议，明确专利的使用许可、收益分配等权利和义务。这可以避免未来因专利归属或使用问题产生的纠纷。
友好协商：如果您希望继续参与相关技术研发或希望获得与该专利相关的奖励或报酬，可以与原公司进行友好协商。双方可以就合作方式、收益分配等事项达成一致意见。
三、员工义务与权利
保密义务：您对在工作期间知悉的公司专利技术等商业秘密负有保密义务。即使离职后，您也不能擅自泄露或使用这些商业秘密，否则可能面临法律责任。
不得侵权：您不能擅自使用公司的专利技术用于生产经营等活动，否则构成专利侵权。公司有权要求您停止侵权行为并赔偿损失。
获得奖励或报酬：对于职务发明，您有权根据公司规定或双方约定获得相应的奖励或报酬。如果公司未按照约定支付奖励或报酬，您可以通过法律途径维护自身权益。
四、纠纷解决途径
如果双方就专利归属、保密义务履行等方面出现纠纷，可以尝试以下解决途径：
协商调解：双方可以首先尝试通过协商或第三方调解机构进行调解，以达成一致意见。
仲裁或诉讼：如果协商或调解无法解决问题，任何一方都可以向仲裁机构申请仲裁或向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，需要提供充分的证据来支持自己的主张。
五、后续跟进
离职后，您应关注公司对专利的处理情况。如发现公司侵犯了您的专利权或未按照约定支付奖励报酬等，应及时通过法律途径维护自身合法权益。
综上所述，处理公司申报的专利在离职后的相关问题需综合考虑专利的性质、双方是否有特殊约定以及相关法律法规的规定。建议您在离职时与公司做好沟通并签订相关协议，以明确双方的权利和义务，并在必要时通过法律途径维护自身权益。