结论：单位申请专利后，如果员工辞职，专利的归属需根据是否为职务发明创造以及是否存在特别约定来综合判断。
一、职务发明创造的情况
定义与范围：
- 职务发明创造是指员工在执行本单位的任务或主要利用本单位的物质技术条件所完成的发明创造。这包括在本职工作中、履行单位交付的额外任务中，以及退休、调离原单位后或劳动、人事关系终止后1年内与其原工作相关的发明创造。
专利权归属：
- 根据《中华人民共和国专利法》第六条，职务发明创造申请专利的权利属于单位，申请被批准后，单位为专利权人。因此，如果员工在职期间完成的发明创造属于职务发明创造，那么即使员工辞职，专利权仍归单位所有。
员工权益：
- 尽管专利权归单位，但依据《中华人民共和国专利法》第十五条，被授予专利权的单位应当对职务发明创造的发明人或者设计人给予奖励；发明创造专利实施后，根据其推广应用的范围和取得的经济效益，对发明人或者设计人给予合理的报酬。国家还鼓励单位采取股权、期权、分红等方式，使发明人或者设计人合理分享创新收益。
特别约定：
- 如果单位与发明人之间有特别的合同约定，对专利权利的归属进行了不同于法律规定的安排，那么应遵循该约定。
二、非职务发明创造的情况
定义与范围：
- 非职务发明创造是指与员工本职工作无关，且未利用单位物质技术条件完成的发明创造，或者虽然利用了单位物质技术条件，但与单位有明确合同约定专利归属员工的情形。
专利权归属：
- 在这种情况下，申请专利的权利属于发明人或设计人，申请被批准后，发明人或设计人为专利权人。因此，如果员工完成的发明创造属于非职务发明创造，那么员工辞职后，专利权仍归员工个人所有。
证据要求：
- 员工需提供充分证据来证明其发明创造属于非职务发明创造，以确保其专利权的合法性。
三、离职后的影响与建议
- 对于职务发明创造，员工离职不影响专利权的归属，专利权仍归单位所有。员工应了解并遵守单位的相关规定，同时关注自己应得的奖励和报酬。
- 对于非职务发明创造，员工离职后可直接享有其专利权。员工应妥善保管相关证据，以证明其发明创造的独立性。
- 无论何种情况，若之前申请的专利在离职后获得授权，员工都有权根据公司规定及相关法律法规获得相应的奖金或报酬（如有约定）。
- 建议：为了避免后续纠纷，单位和员工在签订劳动合同时，应明确专利权的归属约定。对于职务发明创造，单位可以制定详细的奖励和报酬制度，以激励员工的创新积极性。对于非职务发明创造，员工应保留好相关证据，以证明其发明创造的独立性。
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