结论前置：员工工作时间不在岗位，用人单位能否辞退需根据具体情况判断。若员工无故离岗且达到公司规章制度规定的可解雇情形，或严重违反公司规定、给公司造成重大损害，用人单位可以依法辞退且无需支付经济补偿；但若员工有正当理由不在岗位，或公司规章制度不合法、未履行正当程序，则用人单位不能随意辞退，否则可能构成违法解除并需支付赔偿金。
可以辞退的情形
严重违反用人单位规章制度
- 前提条件：用人单位必须依法制定规章制度，并明确将“工作时间不在岗位”等情形列为严重违纪行为。该规章制度需通过民主程序制定，并向员工进行公示或告知。
- 实施步骤：当员工出现工作时间不在岗位的情况时，用人单位应进行调查核实，确认员工行为确实属于严重违反规章制度后，方可依据规章制度辞退员工，且无需支付经济补偿。
- 示例：如公司《员工手册》规定，员工连续三次在正常工作时间内擅自离岗即构成严重违纪，公司有权解除劳动合同。若员工李某多次在上班时间擅自外出，经调查取证后，公司可依据此规定合法辞退李某。
不能胜任工作且经过调岗或培训后仍不能胜任
- 适用条件：员工因能力或工作态度导致不能完成工作任务，且经过用人单位考核认定为不能胜任工作。
- 法定程序：用人单位应先对员工进行培训或者调整工作岗位，若员工在新岗位或培训后仍不能胜任工作，用人单位可提前三十日以书面形式通知员工或者额外支付员工一个月工资后，解除劳动合同。
- 示例：员工张某因工作态度问题导致业绩不达标，被认定为不能胜任当前岗位。公司安排张某参加相关培训，但培训后业绩仍未改善。随后公司将张某调整到其他岗位，然而张某依然不认真工作，无法胜任新岗位。在这种情况下，公司可依法解除与张某的劳动合同。
严重失职，给用人单位造成重大损害
- 如果员工工作时间不在岗位的行为导致用人单位遭受重大经济损失或声誉损害，用人单位可以根据《劳动合同法》第三十九条的规定辞退员工，同样无需支付经济补偿。
- 示例：员工王某在上班时间擅自离岗，导致公司重要客户流失，给公司造成重大经济损失。公司经调查核实后，可依据此规定辞退王某。
不能辞退的情形
员工有正当理由不在岗位
- 员工因不可抗力因素（如自然灾害、突发重大疾病等）无法在岗位，并及时向用人单位说明情况并提供相关证明材料，或员工依法享受婚假、产假、丧假、病假等法定假期，用人单位不能以员工不在岗位为由辞退员工。
- 示例：员工赵某因突发疾病需要住院治疗，向公司提交了病假申请并提供了医院证明。在赵某病假期间，公司不能以赵某不在岗位为由辞退他。
用人单位规章制度不合法
- 若用人单位规章制度制定程序不合法，未经民主程序或内容违反法律法规强制性规定，则该规章制度不能作为辞退员工的依据。即使员工工作时间不在岗位，用人单位以此为由辞退也可能被认定为违法解除。
- 示例：公司《员工手册》中规定“员工工作时间不在岗位一次即构成严重违纪，公司有权解除劳动合同”，但该规定未经民主程序制定且未向员工公示。若公司以此为由辞退员工，可能构成违法解除。
未履行正当程序
- 用人单位在辞退员工前，应履行通知员工、听取解释等正当程序。若直接辞退而未履行这些程序，也可能构成违法解除。
- 示例：公司发现员工孙某工作时间不在岗位后，未进行调查核实也未听取孙某的解释，直接辞退了孙某。孙某申请劳动仲裁后，公司可能因未履行正当程序而被认定为违法解除。
违法辞退的后果
- 如果用人单位违法辞退员工，根据《劳动合同法》第八十七条，用人单位应按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
建议：用人单位在面对员工工作时间不在岗位的情况时，应仔细分析具体原因和公司的相关规定，确保在合法合规的前提下做出决策。如有任何疑问或遇到复杂情况，可以直接向我咨询以获取准确的法律意见。