结论：工伤未上报且三年后辞职，单位是否赔偿及如何赔偿的问题，需分情况讨论。一般来说，若未在规定时间内申请工伤认定，可能难以直接获得工伤赔偿；但若存在特殊情况或能证明工伤事实，仍有可能通过法律途径争取赔偿。

详细分析：

1. 工伤认定的时效性：

   • 根据《工伤保险条例》及相关规定，职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。
   • 如果用人单位未按规定提出工伤认定申请的，工伤职工或者其近亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
   • 关键点：若工伤发生后未在上述规定时间内申请工伤认定，则可能失去通过工伤保险获得赔偿的机会。

2. 三年后辞职的赔偿问题：

   • 若未申请工伤认定：在大多数情况下，如果工伤发生后三年内未申请工伤认定，且没有特殊情况（如用人单位承认工伤事实、有充分证据证明工伤等），则可能难以直接获得工伤赔偿。因为工伤保险的赔偿是基于工伤认定的结果，没有工伤认定，就无法享受工伤保险待遇。
   • 若存在特殊情况：如果尽管未在规定时间内申请工伤认定，但存在特殊情况（如用人单位承认工伤、有医疗记录、证人证言等证明工伤事实），则工伤职工仍有可能通过法律途径（如提起民事诉讼）争取赔偿。但这种情况下，赔偿的金额和方式可能不同于工伤保险待遇，且需要承担更多的举证责任。

3. 赔偿的计算：

   • 若获得工伤认定：赔偿金额将根据工伤等级、工资水平、地区标准等因素确定。具体计算公式可能涉及一次性伤残补助金、伤残津贴、医疗费用、停工留薪期工资等多个方面。
   • 若未获得工伤认定但通过法律途径争取赔偿：赔偿金额将根据实际损失、过错程度等因素由法院判决确定。这种情况下，赔偿金额可能不如工伤保险待遇确定，且需要花费更多的时间和精力。

建议：

• 尽快申请工伤认定（如果尚未超过时效）：如果工伤发生后尚未超过1年的申请时效，应尽快向社会保险行政部门提出工伤认定申请。
• 收集证据：无论是否超过申请时效，都应尽可能收集与工伤相关的证据（如医疗记录、证人证言、工作记录等），以备不时之需。
• 咨询专业律师：由于工伤赔偿问题涉及复杂的法律程序和规定，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。

示例：

假设某职工在2020年发生工伤，但未在规定时间内申请工伤认定。在2023年辞职时，该职工发现无法直接获得工伤赔偿。如果该职工能够提供充分的证据证明工伤事实（如医疗记录、同事证言等），并咨询专业律师后，可能通过提起民事诉讼的方式争取一定的赔偿。但具体赔偿金额和方式将由法院根据实际情况判决确定。